学术委员会是实验室学术领导机构，主要负责审议研究方向、研究内容及战略发展计划；审议年度科研工作计划、开放课题、合作交流及学术方面其他重大事宜。学术委员会由相关学科领域9位知名学者组成，设主任1名，副主任1名。具体成员如下：

主任：

王  浩：中国水科院，教授级高工，中国工程院院士

副主任：

华尔天：im体育，研究员，校长

委员：

严登华：中国水科院，教授级高工

陈  舟：浙江省水利水电勘测设计院，教授级高工

袁  越：河海大学，教授

唐德善：河海大学，教授

曹永强：辽宁师范大学，教授

雷晓辉：中国水科院，教授级高工

潘存鸿：浙江省水利河口研究院，教授级高工