一、管理服务机构
1、办公室
2、组织部（统战部）、机关党委（合署）
3、宣传部（新闻中心）
4、纪检监察室
5、人事处（教师工作部）
6、教务处
7、科技处（学科建设办公室、学报编辑部）
8、学生工作部（学生处）
9、发展规划处（高教研究室）
10、计划财务处（资产管理办公室）
11、审计处
12、实验室与设备管理处（采购中心）
13、保卫处（人民武装部）
14、社会合作处（校友办公室、产学合作办公室）
15、总务处（后勤服务中心）
16、校园建设处
17、国际交流与合作处（港澳台办公室）
二、群团组织
1、工 会（离退休工作办公室）
2、团 委
三、教学、科研及教辅机构
1、水利与环境工程学院
2、建筑工程学院
3、测绘与市政工程学院
4、机械与汽车工程学院
5、电气工程学院
6、经济与管理学院
7、信息工程学院
8、国际教育交流学院
9、马克思主义学院
10、基础教学部
11、体育与军事教育部
12、继续教育学院（浙江河（湖）长学院）
13、创业学院（工程实验实训中心）
14、图书馆
15、现代教育技术中心
16、教学质量与评估中心（教师教学发展中心）
17、浙江水利与海洋工程研究院
18、浙江水文化研究院
